MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012943	TG	3	6	1202057	1202062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_012943	GTCG	3	12	1202068	1202079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_012943	ATG	2	6	1205275	1205280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_012943	GCC	2	6	1205298	1205303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_012943	GAT	2	6	1205356	1205361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_012943	GTC	2	6	1205432	1205437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_012943	CGGGT	2	10	1208570	1208579	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2008	NC_012943	AGG	2	6	1208586	1208591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_012943	GCG	2	6	1209489	1209494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_012943	CTTC	2	8	1211502	1211509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_012943	GCC	2	6	1211614	1211619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_012943	CGA	2	6	1211666	1211671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_012943	CGGC	2	8	1211784	1211791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_012943	AGGG	2	8	1211793	1211800	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_012943	CGC	3	9	1213564	1213572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_012943	GTC	2	6	1213589	1213594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_012943	ACT	2	6	1213641	1213646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_012943	CGG	2	6	1213662	1213667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_012943	CGG	2	6	1213737	1213742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_012943	TCC	2	6	1213758	1213763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2021	NC_012943	AAC	2	6	1213817	1213822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_012943	CAGAA	2	10	1220477	1220486	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_012943	TTG	2	6	1220498	1220503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_012943	CGGC	2	8	1220548	1220555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_012943	GTT	2	6	1220561	1220566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2029	NC_012943	CGA	2	6	1221482	1221487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_012943	GAG	3	9	1221504	1221512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_012943	CGA	2	6	1221535	1221540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_012943	GAG	3	9	1221557	1221565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_012943	CGA	2	6	1221588	1221593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_012943	GAG	3	9	1221610	1221618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_012943	CAA	2	6	1222196	1222201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_012943	CAGC	2	8	1224262	1224269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_012943	GCC	2	6	1224284	1224289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2038	NC_012943	CAGC	2	8	1224319	1224326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_012943	CGGG	2	8	1226188	1226195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2040	NC_012943	CGG	2	6	1226197	1226202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_012943	CGG	2	6	1226824	1226829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_012943	TTC	2	6	1226860	1226865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_012943	TGGA	2	8	1226882	1226889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_012943	CTGC	2	8	1228995	1229002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_012943	CAG	2	6	1229006	1229011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2048	NC_012943	CGG	2	6	1229077	1229082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_012943	TGT	2	6	1229083	1229088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_012943	CAG	2	6	1229113	1229118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_012943	TGC	2	6	1229122	1229127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_012943	GCC	2	6	1229199	1229204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_012943	TTCA	2	8	1234473	1234480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2054	NC_012943	CCA	2	6	1234495	1234500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_012943	GAC	2	6	1235397	1235402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2057	NC_012943	CCACG	2	10	1235504	1235513	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2058	NC_012943	CGG	2	6	1235535	1235540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_012943	CGT	2	6	1235568	1235573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_012943	CTT	2	6	1235611	1235616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_012943	GCC	2	6	1235624	1235629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_012943	GCC	2	6	1235677	1235682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2063	NC_012943	CCGA	2	8	1235686	1235693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_012943	GCG	2	6	1236370	1236375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_012943	GGT	2	6	1236467	1236472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2067	NC_012943	ACG	2	6	1238398	1238403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_012943	CGG	2	6	1239101	1239106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_012943	G	6	6	1239129	1239134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2077	NC_012943	CGG	2	6	1245992	1245997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2081	NC_012943	AACC	2	8	1251753	1251760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2084	NC_012943	GCG	2	6	1253297	1253302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2085	NC_012943	GCCGG	2	10	1257694	1257703	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2099	NC_012943	GGC	2	6	1271563	1271568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2106	NC_012943	ATAGT	2	10	1278312	1278321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_012943	TCGGT	2	10	1280996	1281005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2113	NC_012943	TCC	2	6	1281057	1281062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2114	NC_012943	CGGC	2	8	1281066	1281073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2119	NC_012943	GTCGT	2	10	1290406	1290415	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2120	NC_012943	GTC	2	6	1290483	1290488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_012943	GTC	2	6	1290553	1290558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2123	NC_012943	ATC	2	6	1290620	1290625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_012943	GTC	2	6	1290628	1290633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_012943	GTC	2	6	1290699	1290704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2129	NC_012943	GTC	2	6	1290846	1290851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_012943	GCC	2	6	1290910	1290915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2131	NC_012943	GTC	2	6	1290919	1290924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_012943	GTC	2	6	1290990	1290995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_012943	GTC	2	6	1291063	1291068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2137	NC_012943	CTG	2	6	1291185	1291190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2139	NC_012943	GTC	2	6	1291216	1291221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2162	NC_012943	CTCAG	2	10	1293324	1293333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2232	NC_012943	GCC	2	6	1320743	1320748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2233	NC_012943	TCGA	2	8	1320934	1320941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2236	NC_012943	AG	3	6	1321040	1321045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2239	NC_012943	TGC	2	6	1327997	1328002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2240	NC_012943	CCA	2	6	1328021	1328026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2243	NC_012943	TCG	2	6	1328082	1328087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_012943	CGGG	2	8	1330292	1330299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2245	NC_012943	CTT	2	6	1330389	1330394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_012943	TTC	2	6	1330420	1330425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_012943	CAC	2	6	1330432	1330437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2248	NC_012943	CT	3	6	1330479	1330484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2249	NC_012943	TGA	2	6	1331406	1331411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_012943	GAG	2	6	1331838	1331843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_012943	TACA	2	8	1331880	1331887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2252	NC_012943	GCC	2	6	1331985	1331990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2253	NC_012943	CTC	2	6	1332015	1332020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_012943	CGC	2	6	1332108	1332113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2255	NC_012943	ATCG	2	8	1332126	1332133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2380	NC_012943	CGG	2	6	1414998	1415003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2382	NC_012943	TGC	2	6	1415029	1415034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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